Giai đoạn tiếp theo (từ ngày 16-5 cho đến khi hoàn thành dự án), sẽ rào chắn thi công cầu vượt nút giao An Dương - đường Thanh Niên. Giai đoạn này sẽ tổ chức giao thông một chiều cho tất cả các phương tiện trên đường Nghi Tàm theo hướng từ đường Thanh Niên đến đường Âu Cơ như sau: Đoạn từ đường Thanh Niên đến ngõ 108 Nghi Tàm đi trên làn đường tạm rộng 5,5m và đoạn từ ngõ 108 Nghi Tàm đến đường Âu Cơ đi trên làn đường mới rộng 8,5m; tổ chức giao thông một chiều cho ô tô trên đường gom 5m trong đê theo chiều từ đường Âu Cơ đến đường Thanh Niên.
Sở GT-VT Hà Nội yêu cầu Ban Quản lý dự án đầu tư xây dựng công trình giao thông Hà Nội và các nhà thầu thi công bố trí đầy đủ hệ thống biển báo; phối hợp với các lực lượng chức năng lên phương án, bố trí chốt trực tại hai đầu khu vực thi công.
Sau khi hoàn thành từng hạng mục công trình phải khẩn trương thu hồi rào chắn, thu dọn mặt bằng, trang thiết bị thi công và vệ sinh công trường. Các phương tiện tham gia thi công phải được đăng ký và cấp phép của các cơ quan chức năng thành phố.