Đến nay, quy hoạch tổng mặt bằng toàn bộ các hạng mục của dự án, 3 ga trên cao, 6/7 ga ngầm và đoạn tuyến đi ngầm đã được phê duyệt và đang tiến hành giải phóng mặt bằng. Chỉ còn ga ngầm C9 - Ga hồ Hoàn Kiếm chưa được phê duyệt do vị trí tuyến, ga có phần nằm trong vùng bảo vệ II của Di tích lịch sử quốc gia và thắng cảnh hồ Hoàn Kiếm.
Tại tọa đàm, các đại biểu đều ủng hộ phương án vị trí ga C9 tại phía trước Tổng công ty Điện lực Hà Nội, bên dưới đường Đinh Tiên Hoàng và vườn hoa Bờ Hồ với nhiều ưu điểm: Không ảnh hưởng đến vùng bảo vệ I của di tích (hồ Hoàn Kiếm, Tháp Bút...), có đủ không gian bố trí các công trình phụ trợ, không ảnh hưởng tới các công trình lân cận, bảo đảm khoảng cách hợp lý đến các ga kết nối khác. Phương án này cũng được các bộ, ngành liên quan thống nhất, chấp thuận. Tuy nhiên, các đại biểu cho rằng, cần xem xét lại vị trí cửa lên xuống số 3 (khu vực nhà vệ sinh công cộng tại vườn hoa Bờ Hồ hiện tại) và cần có giải pháp kỹ thuật trong thi công xây dựng, phân luồng lên xuống tại các cửa ra vào...