Theo đó, Sở GT-VT Hà Nội điều chỉnh hành trình hoạt động của các tuyến vận tải đang khai thác đi qua đường gom đại lộ Thăng Long có điểm đầu, điểm cuối từ Bến xe Yên Nghĩa đi các tỉnh nói trên theo hướng: Bến xe Yên Nghĩa - quốc lộ 6 - Quang Trung - Lê Trọng Tấn - đường gom đại lộ Thăng Long - rẽ trái vào đường chính đại lộ Thăng Long tại lối vào đầu tiên - đường chính đại lộ Thăng Long - nút giao ngã tư Big C, đường Phạm Hùng, đường Khuất Duy Tiến và đại lộ Thăng Long - đường Khuất Duy Tiến (đi các tỉnh Hải Phòng, Hải Dương, Hưng Yên) - đường vành đai 3 trên cao (đoạn Khuất Duy Tiến - Yên Sở) - cầu Thanh Trì hoặc đường Phạm Hùng (đi các tỉnh Thái Nguyên, Bắc Kạn, Vĩnh Phúc, Yên Bái, Tuyên Quang, Lào Cai) - đường trên cao vành đai 3 (đoạn Phạm Hùng - cầu vượt Mai Dịch) - cầu Thăng Long - quốc lộ 2 (hoặc quốc lộ 3).

Chiều từ các tỉnh về Bến xe Yên Nghĩa theo hướng: Đường vành đai 3 trên cao - đường chính đại lộ Thăng Long - rẽ phải ra đường gom đại lộ Thăng Long gần nút giao cầu vượt đường 70 - đường 70 - đường 72 - đường Lê Trọng Tấn - đường Quang Trung - quốc lộ 6 - Bến xe Yên Nghĩa.

Đối với các tuyến xe từ Bến xe Yên Nghĩa đi qua Việt Trì, Vĩnh Yên lên các tỉnh phía Tây Bắc hiện nay đang đi theo đường Phạm Hùng - Phạm Văn Đồng - cầu Thăng Long - quốc lộ 2..., tạm thời giữ nguyên lộ trình, tuy nhiên về lâu dài sẽ điều chỉnh đi theo hướng quốc lộ 6 hoặc đại lộ Thăng Long lên quốc lộ 21 - Sơn Tây - cầu Vĩnh Thịnh - quốc lộ 2.