Phương án 2, tổ chức lễ khai mạc, bế mạc có khán giả (không quá 50% cơ số ghế của Sân vận động quốc gia Mỹ Đình và Cung Điền kinh). Đối với các quan chức, trọng tài, huấn luyện viên, vận động viên các nước vẫn thực hiện “cơ chế bong bóng khép kín” hoặc theo phương án của Tiểu ban Y tế và kiểm tra doping. Các quan chức, đại biểu, lực lượng phục vụ, khán giả đến tham dự lễ khai mạc, bế mạc phải tiêm đủ 3 mũi vắc xin phòng Covid-19 (mũi 3 đã qua 14 ngày), có kết quả xét nghiệm Covid-19 âm tính trong thời hạn 24 giờ, thực hiện nguyên tắc "5K" của Bộ Y tế.
Phương án 3, tổ chức lễ khai mạc, bế mạc trong “cơ chế bong bóng khép kín” (kịch bản, phương án các tình huống diễn biến dịch bệnh sẽ do Bộ Y tế, Sở Y tế Hà Nội và Tiểu ban Y tế và Kiểm tra doping phối hợp xây dựng cụ thể, báo cáo Ban Chỉ đạo, Ban Tổ chức SEA Games 31 phê duyệt).