Theo đó, có ba bị can là thủ phạm vụ án bị truy tố vử tội "Giết người" gồm Phan Huy Nam, 34 tuổi, trú tại thôn Chợ; Nguyễn Văn Quân, 27 tuổi, trú tại thôn Đá Trắng, đửu thuộc xã Thống Nhất, huyện Hoà nh Bồ và Đặng Thế Sơn, 30 tuổi, ở phường Cẩm Thạch, thị xã Cẩm Phả, cùng thuộc tỉnh Quảng Ninh. Một bị can bị truy tố do phạm tội "Che giấu tội phạm" là Đặng Văn Song (anh trai bị can Đặng Thế Sơn), 35 tuổi, ĐKTT tại phường Cẩm Thạch, thị xã Cẩm Phả, tỉnh Quảng Ninh, chỗ ở: thôn Cặp Tiên, xã Đông Xá, huyện Vân Đồn, tỉnh Quảng Ninh.
Theo kết luận điửu tra, được sự đồng ý của Bùi Viết Cương, Quản đốc phân xưởng Dịch vụ, Công ty cổ phần Cảng Là ng Khánh, Phan Huy Nam và Đặng Thế Sơn đã tổ chức cho người và o khu vực quản lý của cảng nà y để mót vét than rơi vãi.
Trước thời điểm xảy ra vụ án một ngà y, tức là và o buổi sáng 14/12/2008, Đỗ Đức Tâm (còn gọi là Tâm "Trọng"), ở phường Cao Thắng, TP Hạ Long, dẫn theo một nhóm năm thanh niên ở TP Hạ Long và o khu vực cảng Là ng Khánh để tìm mua than.
Tại đây, nhóm Tâm đã gặp và biết Đặng Thế Sơn đang trông đống than khoảng hơn 10 tấn mới vét được nên đặt vấn đử với Sơn để mua. Sơn đồng ý bán nhưng Tâm không trả giá mà hẹn tối sẽ quay lại rồi dẫn nhóm thanh niên đi cùng ra vử.
Biết chuyện nhóm Tâm "Trọng" và o bãi tìm và gạ mua than, Phan Huy Nam, Nguyễn Văn Quân cùng Đặng Thế Sơn phân tích, rồi cùng thống nhất nhận định: Nhiửu khả năng và o tối 14/12/2008, bọn Tâm sẽ kéo quân đến cảng để cướp bãi than và quyết tâm sẽ tổ chức đánh trả nếu bị cướp. Sau đó, Phan Huy Nam đã chuẩn bị cho cả bọn ba khẩu súng loại bắn đạn hoa cải và khoảng hơn 30 viên đạn rồi cùng nhau đi và o cảng Là ng Khánh. Đến nơi, Nam, Quân, Sơn chia nhau mỗi người một khẩu súng và hơn 10 viên đạn rồi đi ngủ.
Khoảng hơn 3h ngà y 15/12/2008, cả ba thức dậy và phát hiện có một nhóm người đang xúc đống than mà Nam, Sơn đã thu gom được để đưa xuống thuyửn. Ngoà i ra, có bảy người đi lại xung quanh số người xúc than. Thấy nhóm trộm cắp than của mình đông hơn nên Nam, Quân, Sơn không dám ra đuổi mà bảo nhau mang theo súng ra đầu đường lối đi và o cảng để phục sẵn, khi nhóm kia xúc than xong và quay trở ra thì sẽ bắn.
Vử phía nhóm của Đỗ Đức Tâm, sau khi đặt vấn đử và được Đặng Thế Sơn hứa sẽ bán than, tối 14/12/2008, theo hẹn, Tâm tiếp tục dẫn số thanh niên đi cùng buổi sáng và o cảng Là ng Khánh để mua than. Tại đây, cả bọn đã gặp hai người ở Hải Phòng cũng đang đợi bọn Nam, Sơn là Lê Bá Ngọc, 35 tuổi, trú tại Bến Bính, xã Tân Dương, huyện Thuỷ Nguyên và Nguyễn Cao Nguyên, 35 tuổi, trú tại phường Đổng Quốc Bình, quận Ngô Quyửn.
Đợi đến khoảng 3h ngà y 15/12/2008, vẫn không thấy Đặng Thế Sơn, Phan Huy Nam nên Tâm bử vử trước, Nguyên, Ngọc ở lại. Sau khi bà n nhau gọi người bán đống than của bọn Nam, Sơn, Nguyên và Ngọc bảo Bùi Ngọc Đức, 19 tuổi, trú tại tổ 79, khu 5C, phường Bạch Đằng, TP Hạ Long, Quảng Ninh gọi điện cho Đỗ Văn Kỷ, ở thôn 4, xã Thống Nhất, huyện Hoà nh Bồ mang thuyửn đến xúc số than trên để mang đi bán.
Bốc than xong, Đỗ Văn Kỷ cho thuyửn chạy ra khửi khu vực cảng, còn Nguyễn Cao Nguyên và Lê Bá Ngọc lên xe máy đi vử. Lúc nà y, Phan Huy Nam và Đặng Thế Sơn đã phục sẵn nên khi Nguyên và Ngọc vừa đến đầu đường và o cảng Là ng Khánh thì bị Nam, Sơn đồng loạt nổ súng và thiệt mạng tại chỗ.
Sau khi bắn gục hai đối tượng ở đầu đường, Phan Huy Nam và Đặng Thế Sơn tiếp tục mang theo súng lao thẳng, nhả đạn tới tấp vử phía những người vừa trộm cắp than của mình. Tổng cộng, trong buổi sáng kinh hoà ng nà y, Nam và Sơn đã hạ sát sáu người, một người bị trọng thương.
Trên đường bử trốn, Đặng Thế Sơn đã điện thoại thông báo cho anh trai là Đặng Văn Song vử hà nh vi của mình cùng đồng bọn và xin tiửn để chạy trốn. Dù không cho tiửn song Đặng Văn Song đã chuẩn bị cho nhóm hung thủ thuyửn và một số vật dụng khác.
Huy động tổng lực điửu tra, dưới sự chỉ đạo trực tiếp của Đại tá Nhâm Ngọc Tám, Phó Giám đốc Công an tỉnh Quảng Ninh, được sự hỗ trợ của các đơn vị nghiệp vụ thuộc Bộ Công an và Công an một số địa phương, ngà y 23/12/2008, cơ quan CSĐT, Công an tỉnh Quảng Ninh đã ra quyết định khởi tố bị can và quyết định truy nã đối với Phan Huy Nam, Đặng Thế Sơn và Nguyễn Văn Quân vử tội "Giết người".
Đến ngà y 30/12/2008, cơ quan điửu tra tiếp tục thi hà nh Lệnh bắt bị can để tạm giam đối với Đặng Văn Song vử tội "Che giấu tội phạm".
Ngà y 26/12/2008, bắt Nguyễn Văn Quân tại tỉnh Lâm Đồng; ngà y 18/1/2009, bắt các tên Phan Huy Nam và Đặng Thế Sơn khi chúng đang đang lẩn trốn tại tỉnh Bình Dương.