Tới thời nhà Nguyễn, ngôi chùa đã được bà con nhân dân chuyển vử khu đất mới trước cửa Đửn Trung. Qua hai cuộc kháng chiến chống Pháp và chống Mử¹ ngôi chùa lại một lần nữa bị hoang tà n bởi thời gian mưa nắng. Tới năm 1997, được sự đồng ý của các cấp chính quyửn địa phương, phật tử Vương Thị Nhật đã phát tâm kêu gọi công đức để tu sửa lại.
Tới tháng 4 năm 2008, nhận lời thỉnh mời của nhân dân và sự đồng thuận của các cấp chính quyửn; Ban Trị Sự Phật Giáo Tỉnh Hà Tây đã bổ nhiệm Đại đức Thích Đạo Thịnh - ủy Viên Ban Trị Sự - Phó trưởng ban Hoằng Pháp Phật Giáo Tỉnh vử trông nom, trụ trì để hoằng truyửn chính pháp. Ngay sau khi tiếp nhận, Đại Đức đã là m đơn gửi các cấp Chính quyửn và Ban lãnh đạo vườn Quốc Gia Ba Vì; Ban lãnh đạo Công ty cổ phần đầu tư Du Lịch Suối Cái để xin chuyển ngôi chùa vử đúng vị trí cũ.
Được sự chấp thuận của các cấp chính quyửn và các ban ngà nh hữu quan, ngà y 2 tháng 6 năm Mậu tý, tức ngà y 4 tháng 7 năm 2008 nhà chùa và nhân dân đã là m lễ khởi công - động thổ chuyển ngôi chùa mới trước cửa Đửn Trung vử vị trí cũ như hiện nay.
Tản Viên Sơn Quốc Tự
Để đáp ứng nhu cầu tín ngườ¡ng của nhân dân và tín đồ phật tử thập phương, Đại Đức trụ trì đang là m quy hoạch tổng thể, trình UBND Thà nh Phố Hà Nội xin được trùng tu - tân tạo toà n bộ khu chùa trở thà nh một "Đại Tùng Lâm Tu Viện".
Với mô hình kiến trúc theo kiểu "Nội Công Ngoại Quốc"; có Tả Vu, Hữu Vu, Tiửn Phật, Hậu Tổ, cuối Tăng Đường... và khu Nội Viện, vừa đáp ứng nhu cầu tu học, vừa đáp ứng nhu cầu tín ngườ¡ng tâm linh còn mang tầm cỡ Quốc Tế trong tương la. Pho đức Thế Tôn cao 7,78 mét Ngôi Chính Điện với lối kiến trúc Cổ - Kim kết hợp, diện tích khoảng 500m2, được thiết kế theo kiểu 3 cổ chồng diêm mười hai mái. Tôn tượng được thử trong Chính điện gồm có ba pho: Pho đức Thế Tôn cao 7,78 mét; Là tôn tượng bằng gỗ mít lớn nhất khu vực Đông Nam à hiện nay. Còn lại hai bên Tả - Hữu là hai pho Văn Thù và Phổ Hiửn Bồ Tát cao 3,5 mét đã tạo nên cho ngôi chùa vẻ uy nghiêm và tráng lệ.
Hai bên tả hữu phía trước chùa là Tháp Chuông và Tháp Trống. Đối diện trước chính điện là Động Quan à‚m thiên tạo. Tương truyửn nơi đây chính là nơi mà Bồ Tát Quan à‚m đã tu hà nh và truyửn đạo cho Tam vị tối linh thần Tản Viên Sơn Thánh.
Bên tả Chính điện là dãy nhà khách, với lối kiến trúc 2 tầng(tầng trệt là nhà để xe),tổng diện tích khoảng 400m2; Bên hữu Chính điện là dãy Tăng đường với lối kiến trúc 1 tầng mái ngói - khoảng 250m2.
Phía sau Chính điện là biển non bộ với hình "Thần Kim Quy Hai Đầu Bái Phật Cầu Kinh", một kiệt tác thiên nhiên có một không hai của trời Nam. Phía trên Thần Kim Quy là Nhà thử Tổ, Tịnh Thất, Trai Đường, Nhà Trù, Vường Lâm Tử³ Ni, Tuyết Sơn Khổ Hạnh Lâm, Vườn Lộc Uyển, Rừng Sa La Song Thọ...tổng diện tích khoảng 1.000m2.
Trên đường và o khu Nội Viện, phía bên tả chùa là "Long Tỉnh Tuyửn"(giếng rồng tiên). Khi vừa trấn tích xây dựng ngôi chùa, vì không có nước sinh hoạt, Đại Đức trụ trì đã thắp hương cáo bạch với chư vị Thần Linh, xin chư vị dâng cúng Tam Bảo một nguồn nước tịnh. Đêm đến Đại Đức đã được thần nhân báo mộng và chỉ cho nơi đà o giếng. Quả thực giếng vừa đà o được trên 3 mét thì một mạch nước lớn trong xanh đã tuôn trà o. Kể từ đó mùa khô nước giếng không bao giử cạn. Đầu xuân du khách vử trẩy hội thường xin nước ấy vử tẩy trần nhà cửa để cầu được may mắn. Để cảm tạ Thần Linh, Đại Đức trụ trì cho đặt tên giếng là "Long Tỉnh Tuyửn" để hồi ân.
Qua khu giếng tiên là Suối Quan à‚m, được bắt nguồn từ đỉnh Núi Mẹ và một phần của sườn dãy núi Chà ng Rể. Dự kiến toà n bộ khu suối sẽ được đặt 500 tôn tượng A La Hán để nhân dân và tín đồ phật tử thập phương vử chiêm bái và cầu phúc trong tương lai.
Qua Suối Quan à‚m là khu Nội Viện, với diện tích khoảng 6ha, được quy hoạch các công trình lớn mang tầm cỡ Quốc Gia - Quốc Tế, nhằm đáp ứng nhu cầu tu học cho nhân dân và các tín đồ Phật tử thập phương.
Động Quan à‚m Với tổng diện tích quy hoạch như vậy (khoảng trên 20.000m2) phần kinh phí để kiến thiết, xây dựng là rất lớn.
Nằm cách trung tâm Hà Nội khoảng 60 km vử phía tâytọa lạc Xã Minh Quang, huyện Ba Vì,Tản Viên Sơn Quốc Tự chắc chắn sẽ là một địa điểm du lịch tâm linh lý tưởng trong dịp tết nguyên đán nà y.