Theo quyết định thanh tra, thời kỳ thanh tra từ năm 2009 đến năm 2018; khi cần thiết có thể xem xét trước hoặc sau thời kỳ trên. Thời hạn thanh tra là 50 ngày làm việc. Đoàn Thanh tra do ông Ngô Đình Long, thanh tra viên chính, Vụ III, Thanh tra Chính phủ làm trưởng đoàn.
Phó Tổng Thanh tra Trần Ngọc Liêm giao Vụ trưởng Vụ III chỉ đạo, theo dõi, đôn đốc đoàn thanh tra thực hiện nhiệm vụ, chức năng, quyền hạn quy định, xử lý hoặc trình Tổng Thanh tra Chính phủ xử lý theo thẩm quyền các kiến nghị của đoàn thanh tra.
Trước đó, Văn phòng Chính phủ đã có văn bản truyền đạt chỉ đạo của Phó Thủ tướng Thường trực Chính phủ Trương Hòa Bình giao Thanh tra Chính phủ thanh tra toàn diện việc chấp hành quy định của pháp luật về công tác quản lý, sử dụng đất đai, tài sản công tại Khu Liên hợp thể thao quốc gia Mỹ Đình, báo cáo Thủ tướng kết quả.
Quá trình kiểm toán, Kiểm toán Nhà nước đã chỉ ra một số sai phạm về quản lý, sử dụng tài chính và tài sản tại Khu Liên hợp thể thao quốc gia Mỹ Đình. Thông tin đáng lưu ý theo kết luận của Kiểm toán Nhà nước, trong nhiều năm liền, Khu Liên hợp thể thao quốc gia không chỉ cho thuê đất khi chưa được sự đồng ý bằng văn bản của Bộ Văn hóa - Thể thao và Du lịch, Bộ Tài chính; chưa thực hiện kê khai, nộp tiền thuê đất của các hợp đồng cho thuê mặt bằng ngắn hạn và dài hạn, mà còn có dấu hiệu làm sai nguyên tắc trong sử dụng tài chính công, tài sản công…