Thành phố Hà Nội xác định đối với điểm nghẽn về an toàn thực phẩm, có 03 nhóm vấn đề còn tồn tại, cụ thể: Nhóm tồn tại về pháp lý, cơ chế, thể chế, năng lực cán bộ; Nhóm tồn tại về công tác quản lý, hạ tầng, điều kiện kỹ thuật phục vụ kiểm soát an toàn thực phẩm; Nhóm tồn tại về ý thức chấp hành pháp luật, ý thức cộng đồng.