Trung tâm Y tế huyện Sóc Sơn được thành lập năm 1988 theo quyết định số 3025 ngày 30/6/1988 của UBND Thành phố Hà Nội và Quyết định số 494 ngày 22/7/1988 của UBND huyện Sóc Sơn . Tháng 10 năm 2008, sau khi sáp nhập 26 Trạm Y tế xã , thị trấn , đã nâng tổng số cơ sở y tế trực thuộc Trung tâm lên 30 đơn vị Y tế cơ sở và phân đều trên địa bàn toàn huyện .